为了总理的嘱托，王淦昌到达基地后，便率手下的工程技术人员开始了紧张的准备工作。当时他的主要工作是抓缩小尺寸的局部聚合爆轰实验。由于戈壁滩基地特殊的环境，各种车间、工号和实验场相距都十分远，常常为一件事，清晨出发，晚上才能赶到，远望戈壁滩似乎一展如平海，可当你坐在吉普车上飞速行进时，屁股就像坐在搓板上一样难受。年近花甲的王淦昌几乎每天都得在千里宽阔的戈壁滩上来回奔波。
1963年11月20日，这是中国原子弹试验史上应该铭记的—天，这一天虽说不是正式核爆炸，但几乎与核爆炸同等重要。当时参加这项缩小尺寸的整体模型爆轰试验的人不多，可从技术角度而言，王淦昌心里明白：成功，便意味着中国原子弹的正式爆炸日即将到来。因此当基地上千军万马群情激荡时，王淦昌在获得中南海直接批准后，便与彭桓武、郭永怀、邓稼先、朱光亚等进人了紧张的实验实战之中。不用说，那些日子里，王淦昌一天光跑研究室、车间和实验场就得好几个来回……终于有一天他病倒了，血压一下子也髙了起来。这可把基地上上下下吓坏了。