在这种说法的基础上，人们进一步提出：伊藤博文来华应该是政变的真正原因，而御史杨崇伊的密折则是政变的导火线。
因为在变法刚开始的时候，慈禧对变法并不反对，这从慈禧允许光绪颁布《明定国是》的诏书中可以看出。在慈禧太后看来，只要不对她尊贵的地位构成什么威胁，皇帝爱干什么就干什么，她一概不管。康有为等人不过是一介书生，任他再闹也闹不到天上去。
但是在变法期间有几件事情令慈禧感到恐慌，她才决定回宫发动政变。
一是光绪请求启用议事机构懋勤殿，它实质是一个专属于光绪的办事机构。慈禧认为这使光绪完全摆脱了她的控制，使她感到不快。
二是光绪召袁世凯到京，准备授以重任。而袁世凯掌握着兵权，自然引起慈禧警觉。
第三件也是最重要的一件事就是伊藤博文来华。9月12日，正当戊戌变法进行得如火如荼的时候，日本的实力派人物伊藤博文以“私人”的名义访华，维新派因此而大为振奋。康有为等人与伊藤博文接触频繁，许多维新派人士争相向光绪皇帝建议把伊藤博文聘请为顾问，以便辅助新政，同时说“中国转贫为富、转弱为强、转危为安之机实系乎此”。光绪帝采纳维新派的建议，决定9月20日（八月初五）召见伊藤博文。